Les machines de transfert associent des composants de natures différentes (élément de séchoir, appareils de pression, condenseur, régulateur, ventilateur, pompe à vide, etc. ) qui interagissent pour produire un comportement complexe. La conception optimisée, le contrôle et la simulation en vue de pilotage de ces machines se heurtent à la faible modularité et à la lenteur des codes de simulation construits autour de modèles de connaissance de ces systèmes.

Le TREFLE développe une démarche d'aide à la décision en conception préliminaire, appelée Conception Inversée Intégrée (CII), ainsi qu'un logiciel de conduite d'études, MAL’IN®(Méthodes d'Aide à L'INnovation). Des procédés innovants émergent de ces recherches (3 brevets depuis 2001).